Yeni Nesil Dizileme (NGS)

Tüm Genom Dizileme Kat. No Miktar
1Gb, 2x150bp, Paired End BS-NGS-WGS-101 1-5
1Gb, 2x150bp, Paired End BS-NGS-WGS-102 5 ve Fazlası
5Gb, 2x150bp, Paired End BS-NGS-WGS-201 1-5
5Gb, 2x150bp, Paired End BS-NGS-WGS-202 5 ve Fazlası
10Gb, 2x150bp, Paired End BS-NGS-WGS-301 1-5
10Gb, 2x150bp, Paired End BS-NGS-WGS-302 5 ve Fazlası
30Gb, 2x150bp, Paired End BS-NGS-WGS-401 1-5
30Gb, 2x150bp, Paired End BS-NGS-WGS-402 5 ve Fazlası

Açıklama:
Tüm Genom Dizileme (WGS), bir organizmanın genetik yapısının genomik bilgisine kapsamlı bir erişim ve bunların eksiksiz bir gen kümesinin genel görünümünü sağlar. Bir DNA dizisinin belirli bir bölümünde daraltmak yerine, Tüm Genom Dizileme, tek nükleotid varyantlarını, eklemeleri, delesyonları, kopya sayısı değişimlerini ve büyük yapısal varyantları tespit etmek için daha büyük veri kümelerini analiz eder. Bu nedenle, Tüm Genom Dizileme (WGS), uzman tıp, farmakogenomik, agrigenomik, onkojenomik, filogenetik ve biyobelirteç keşfinde atılımlar sağlamayı garanti etmektedir.

Standart Tüm Genom Dizileme Biyoinformatik Analizi

  • Hizalayarak Okuma
  • Tekilleştirme, baz kalitesinde yeniden kalibrasyon ve yerel hizalama  
  • SNP ve Indel adlandırma
de Novo Genom Dizileme Kat. No Miktar
1Gb, 2x150bp, Paired End BS-NGS-DN-101 1-5
1Gb, 2x150bp, Paired End BS-NGS-DN-102 5 ve Fazlası
5Gb, 2x150bp, Paired End BS-NGS-DN-201 1-5
5Gb, 2x150bp, Paired End BS-NGS-DN-202 5 ve Fazlası
10Gb, 2x150bp, Paired End BS-NGS-DN-301 1-5
10Gb, 2x150bp, Paired End BS-NGS-DN-302 5 ve Fazlası
30Gb, 2x150bp, Paired End BS-NGS-DN-401 1-5
30Gb, 2x150bp, Paired End BS-NGS-DN-402 5 ve Fazlası

Açıklama:
Herhangi bir referans dizisi bulunmayan durumlarda genomları karakterize etmek için De Novo Genome dizileme Uygulanır. Bunun yanı sıra, De Novo Genome Dizileme, bilinen genomlarda yapısal varyasyonu araştırmak için de uygulanır.

de novo Genom Toplama Biyoinformatik Analiz

  • de novo Toplama   (<10Mb Genom)   
  • de novo Toplama   (>10Mb Genom) 
RNA Dizileme (RNA-Seq.) Kat. No Miktar
8 million reads, 2x75bp, Single End BS-NGS-RS-101 1-5
8 million reads, 2x75bp, Paired End BS-NGS-RS-102 5 ve Fazlası
20 million reads, 2x75bp, Sibgle End BS-NGS-RS-201 1-5
20 million reads, 2x75bp, Paired End BS-NGS-RS-202 5 ve Fazlası
40 million reads, 2x75bp, Single End BS-NGS-RS-301 1-5
40 million reads, 2x75bp, Paired End BS-NGS-RS-302 5 ve Fazlası
80 million reads, 2x75bp, Single End BS-NGS-RS-401 1-5
80 million reads, 2x75bp, Paired End BS-NGS-RS-402 5 ve Fazlası

Açıklama:
RNA Dizileme (RNA-Seq), transkriptomunu niteliksel ve niceliksel olarak araştırmak için yeni ve etkili bir yaklaşımdır. RNA Dizileme (RNA-Seq), transkriptlerin tam listesini tanımlayabilir, genlerin yapısını tam olarak tanımlayabilir ve gen ekspresyon seviyelerini doğru olarak ölçebilir.

miRNA Dizileme Kat. No Miktar
10 Millions, 100X derinlik BS-NGS-SRS-101 1-5
10 Millions, 100X derinlik BS-NGS-SRS-102 5 ve Fazlası
10 Millions, 200x derinlik BS-NGS-SRS-401 1-5
10 Millions, 200x derinlik BS-NGS-SRS-402 5 ve Fazlası
Ekzom Dizileme Kat. No Miktar
İnsan, 45Mb Ekzom, 40X Kapsam BS-NGS-ES-101 1-5
İnsan, 45Mb Ekzom, 40X Kapsam BS-NGS-ES-102 5 ve Fazlası
İnsan, 45Mb Ekzom, 80X Kapsam BS-NGS-ES-201 1-5
İnsan, 45Mb Ekzom, 80X Kapsam BS-NGS-ES-202 5 ve Fazlası

Açıklama:
miRNA Dizilimi, transkripsiyon sonrası düzenlemenin fenotipe nasıl katkıda bulunduğunu, yeni biyobelirteçlerin tanımlanmasını ve küçük RNA ve miRNA türlerinin tümünün yakalanmasını nasıl sağladığının anlaşılmasını sağlar, çünkü 50-250 nükleotit uzunluğunda kodlamayan RNA moleküllerinin tipi olan küçük niRNA’lar sıklıkla gen expreksiyonunda gen susturulması ve transkripsiyon sonrası düzenlemede rol oynar. miRNA popülasyonları farklı doku tipleri ve türleri arasında önemli ölçüde değişiklik gösterebilir ve miRNA Dizileme genellikle microRNA (miRNA), small interfering RNA (siRNA) and small nucleolar RNA (snoRNA), small nuclear RNA (snRNA) ve piwi-interacting RNA (piRNA) gibi ençok bilinen küçük RNA’lara uygulanır

Ekzom Dizileme Kat. No Miktar
İnsan, 45Mb Ekzom, 40X Kapsam BS-NGS-ES-101 1-5
İnsan, 45Mb Ekzom, 40X Kapsam BS-NGS-ES-102 5 ve Fazlası
İnsan, 45Mb Ekzom, 80X Kapsam BS-NGS-ES-201 1-5
İnsan, 45Mb Ekzom, 80X Kapsam BS-NGS-ES-202 5 ve Fazlası

Açıklama:
Ekzom Dizileme (Exome-Seq), sadece bilinen varyantların çoğunluğundan sorumlu genomun protein kodlama bölgesini hedeflediği için maliyet-etkin bir dizileme metodudur. Ekzom Dizileme (Exome-Seq), hastalıkların teşhisi için en önemli olduğuna inanılan genomun bölümlerini okumak için etkili bir stratejidir.

Hedefli DNA Dizileme Kat. No Miktar
500kb’dan az, 100X derinlik BS-NGS-TDS-101 1-5
500kb’dan az, 100X derinlik BS-NGS-TDS-102 5 ve Fazlası
500kb’dan az, 100X derinlik BS-NGS-TDS-201 1-5
500kb’dan az, 100X derinlik BS-NGS-TDS-202 5 ve Fazlası
500kb’dan az, 200x derinlik BS-NGS-TDS-301 1-5
500kb’dan az, 200x derinlik BS-NGS-TDS-302 5 ve Fazlası
500kb’dan az, 200x derinlik BS-NGS-TDS-401 1-5
500kb’dan az, 200x derinlik BS-NGS-TDS-402 5 ve Fazlası

Açıklama:
Hedefli DNA Dizileme, amplikonlara ve spesifik genlere odaklanan yeni nesil bir DNA dizileme tekniğidir. Hedefli DNA Dizileme, geniş bir çeşitlilikteki organizmaları hedef alabildiğinden, popülasyon genetiğinde yararlıdır. Daha geniş yaklaşımlarla karşılaştırıldığında sıralama maliyetlerini, analiz yüklerini ve geri dönüş süresini azalttığı için Araştırmacılara daha küçük, daha yönetilebilir bir veri seti oluşturarak ilgi alanlarına odaklanmalarını sağlar.

ChIP Dizileme Kat. No Miktar
≥20 Milyon, 100X derinlik BS-NGS-SRS-101 1-5
≥20 Milyon, 100X derinlik BS-NGS-SRS-102 5 ve Fazlası
≥20 Milyon, 200x derinlik BS-NGS-SRS-401 1-5
≥20 Milyon, 200x derinlik BS-NGS-SRS-402 5 ve Fazlası

Açıklama :
ChIP sekanslama (ChIP-Seq), transkripsiyon faktörleri ve diğer proteinler için genom çapında DNA bağlama bölgelerini tanımlamak için güçlü bir yöntemdir. DNA ile ilişkili proteinlerin bağlanma yerlerini tanımlamak için kromatin immünopresipitasyonunu (ChIP) büyük ölçüde paralel DNA dizilimi ile birleştirir. ChIP sekanslama (ChIP-Seq) araştırmacılara gen ekspresyonunu yıkabilecek veya transkripsiyon faktörü bağlanmasının evrimini araştıran faktörleri görselleştirmelerini sağlar.

Biyoinformatik Analiz

Standart Tüm Genom Dizileme Analizi

  • Hizalayarak Okuma                         
  • Tekilleştirme, baz kalitesinde yeniden kalibrasyon ve yerel hizalama
  • SNP ve Indel adlandırma

de novo Genom Toplama

  • de novo Toplama   (<10Mb Genom) 
  • de novo Toplama   (>10Mb Genom)                                                                                         

Genom Ek Açıklaması

  • Gen Tahmini
  • Tekrarlaya Elementler
  • İşlevsel Ek Açıklama

Standard RNA Dizileme Analizi

  • Standart araştırmacı biyoinformatik analizi
  • Okuma Haritası
  • Göreceli gen ekspresyon seviyesi tahmini        

Standart miRNA Dizileme Analizi

  • Küçük kodlayıcı olmayan RNA’ların gen açıklaması (mikroRNA’lar, snoRNA’lar, tRNA’lar, vb.)
  • Küçük kodlamayan RNA’ların diferansiyel gen ekspresyon analizi
  • MikroRNA genlerinin ve hedeflerinin tahmini

Genel Bakış

  • Illumina MiSeq ve HiSeq Platformları
  • Başlangıç Malzemesi Olarak 1 µg Genomik DNA
  • 150bp Paired End Dizileme
  • Biyoinformatik Analiz
  • 5  Hafta Dönüş Süresi
  • 3 Aylık Veri Depolama
Hizmetler